Filipa Cortesão Silva completó su doctorado en Antropología, especialización en Antropología Biológica por la Universidade de Coimbra en 2019, habiendo disfrutado de una beca de la Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT). Entre septiembre de 2022 y enero de 2023 disfrutó de un contrato Juan de la Cierva-formación en el Instituto de Arqueología de Mérida (CSIC-Junta de Extremadura), donde pudo dar continuidad a su línea de estudios. Desde febrero de 2023 es investigadora principal de un proyecto de excelencia I+D+i (PAIDI 2021) en la Universidad de Sevilla sobre las prácticas funerarias en Astigi (Écija, Sevilla) en perspectiva diacrónica (siglos I a.C.- VIII d.C.). Hace más de una década integra el Centro de Investigação em Antropologia e Saúde (CIAS) de la Universidade de Coimbra, referencia internacional en esta área.
En los últimos años, desarrolló investigación sobre la bioarqueologia de la cremación en la provincia romana de la Lusitania. Esta se ha centrado en el análisis antropológico de restos óseos de necrópolis urbanas asociadas a Augusta Emerita (Mérida, Spain) y Salacia (Alcácer do Sal, Portugal). Ha estudiado, además, áreas funerarias romanas de la provincia Tarraconense y, presentemente, de la Bética. Otros intereses se centran en el análisis de las prácticas funerarias de populaciones pretéritas según su perfil biológico (edad y sexo) y señales de enfermedades (Paleopatología).